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纳米孔测序仪

三代纳米孔平台测序(MinION、GridION MK1)

应用领域:
1、即时检测传染源
     MinION在测序读长,携带的方便性,检测时长方面具有相当的优势。文献记载从样品放置机器到发现致病菌只需要4分钟。
2、MinION可以在胎儿非整倍体产前检测中发挥重要作用。
3 、太空应用
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产品特点

纳米孔测序仪
原理:
 MinION纳米孔测序仪的核心是一个有2,048个纳米孔,分成512组,由专用集成电路控制的flow cell。

应用范围

纳米孔测序
1、碱基修饰的检测
   纳米孔测序技术可以检测四种胞嘧啶(cytosine)碱基修饰,分别为5-methycytosine,5-hydroxymethycytosine,5-formylcytosine和5-carboxylcytosine。检测准确率为92%-98%。
2、实时测序监控
   对于临床实践,实时获取和分析DNA/RNA序列是一件很重要的事情。对于传统的NGS测序,做到这一点非常不易。但对于MinION,实现起来相对容易。这不仅是因为MinION体积小,易操作等,更是因为在测序过程中单分子穿过纳米孔,其电流变化可以检测并识别,这种设计允许用户在测序过程中根据实时结果做出一些判断。
   实时测序监控对于MinION针对特定目标序列测序有重要的应用(图2):当DNA片段通过纳米孔时,如果电流变化呈现与目标序列一样的趋势,则通过纳米孔。如果DNA片段与目标序列呈现不同的电流变化趋势,则不能通过纳米孔。通过这样的方式,实现目标序列的富集,从而显著减少测序时间,对于在野外和即时诊疗有重要意义。
3、测得更长的read
    用MinION测序仪,对于1D read可以获得300kb长的read;对于2D read可以获得60kb长的read。利用MinION测序仪产生的长read,研究人员设法填充了人参考基因组Xq24号染色体一个长50kb的gap。该区域存在多个CT47基因串联拷贝,研究人员利用MinION的长read判断该区域极有可能存在8个CT47基因拷贝
4、结构变异的检测
    NGS短序列的特征使结构变异的检测往往不准确。这个问题在癌症的检测中尤其严重,这是因为癌症组织中充斥各种结构变异。研究人员发现利用MinION测得的几百个拷贝的长read得到的结构变异结果比NGS平台测得的上百万read得到的结果更可靠。
5、RNA表达分析
    对于RNA表达分析,NGS平台测得的短序列带来的问题是序列需要进行拼接,才能得到转录本。这给可变剪切研究带来困扰。因为通常情况下NGS测序不能产生足够的信息将不同形式的可变剪切区分开来。而利用MinION测序仪产生的长read,可以更好地解决这个问题。研究人员利用果蝇的Dscam1基因为例,其存在18,612种可变剪切形式,利用MinION测序仪可以检测到超过7,000种可变剪切形式,而这样的结果利用NGS的短序列测序是不能够获得的。

四大优势

专业实验室

科润达生物拥有P2级实验室及GMP车间,严格按食药监械监2015-218号令医疗器械生产质量管理规范体外诊断试剂现场检查指导原则的相关要求管理。

学术态度严谨

国家注册检验师带领的实验团队,严格落实检验操作每一处细节,实验标准品定期更新,定期与外部实验室做实验数据比对等,确保实验数据的严谨。

数据客观准确

科润达生物为您配备了有着二十多年免疫专业和经验丰富的技术团队,可以为您提供客观真实的实验数据,并承诺所用的检测试剂均为优质的原装进口产品。

服务高效快捷

科润达生物以客户服务为导向,实验室管理体系与业务接口无缝对接,确保用户需求及时得到分析评价、可以为用户分析测试结果、协助用户解决技术问题

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